1.根据病原菌针对性用药。本病除大家较了解的支原体和衣原体外（主要感染微生物），还有10%—20%的可由阴道毛滴虫、白色念珠菌、金黄色葡萄球菌、链球菌、酵母菌、厌氧革兰阴性杆菌等引起。所以非淋的治疗要因人而异，因感染的微生物而确定用药。
2.足够的疗程。支原体和衣原体是细胞内寄生的微生物，对抗生素不如一般的细菌敏感，所以用药时间应该相对较长，一般为两周左右。患者最好不要自行盲目购药服用，这样可能使病原菌接触到药物又没杀灭而产生耐药，下次此药就不管用了。
3.最好单一用药。药物之间相互作用是复杂多变的。一般来说，除非知道它们之间有协同互补作用，否则不应该同时用两种以上的药物来治疗非淋菌尿道炎。因为，这样做常常有害而无益，如药物之间有相互拮抗作用会降低疗效，增加治疗的费用，使病原菌对药物的耐药菌株增多，从而使进一步治疗难度加大。
4.重视性伴的检查和治疗。因为各种原因有些人患了性病而不愿意让家人知道，所以也忽视了对性伴的诊断和治疗，从而造成反复的感染，这并不代表治疗无效。
5.注意发挥身体的抗病能力。药物治疗的同时需要身体抗病能力的配合才能达到较好的疗效。在治疗期间同时饮酒和继续过性生活（尽管用了安全套）会大大降低疗效，这一点在一些年轻人中较容易忽视。此外，还有生活节奏不规律、食辛辣火锅等食物、过度劳累、有慢性病等情况。
尿道炎应该做哪些检查？
1.尿道刺激症状；
2.尿道口红肿有脓性分泌物沿尿道可有压痛；
3.尿中有多量红细胞白细胞尿三杯试验第一杯尿明显不正常；
4.尿道分泌物涂片染色检查或细菌培养有致病菌可以与淋菌性尿道炎鉴别
孕妇尿路感染用药需注意
众所周知，性活动期妇女的尿路感染远较其他人多发，妊娠妇女比起一般非妊娠者又明显增多，尽管人们已充分注意了这一客观现象，也懂得如何讲究卫生和预防，但毕竟这是一种生理上的薄弱环节，纵然“做足了功夫”亦未能从根本上改变这种态势。幸好，尿路感染只要提高警惕，及早诊断和及时治疗，绝大多数能得以治愈，不会导致过多的损害。妊娠尿路感染则又有别于非妊娠者，因为除了母体之外，还有一个正在不断发育中的小宝贝。无论是医生或是孕妇本人，头脑里必须增加一根弦，注意药物对幼小生命的近期和远期的影响。惧怕药物的不良影响而有病不用药，不行!因为感染对母子都有威胁。不考虑胎儿之承受力而单纯追求杀菌，甚至滥用不适宜药物，也不行！因为“玉石俱焚”简直是罪过。
性交后妇女尿路感染率相当高
此外，病人的性活动也常常受到干扰或中断。错误的信息使病人责备自己，好象感染是自己的卫生习惯不当所致、要不然她们就会责备丈夫，认为感染是丈夫传染给自己的，性交常使她们感到恐怖，因为害怕促使另一次感染。这种不幸的局面可以通过对感染的及时、恰当的诊断和治疗得到控制。就泌尿系感染的病理机制进行充分地教育也很有帮助。如果需要还可采取适当的予防措施。
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